Olivier Marcy occupe actuellement le poste d'épidémiologiste clinique et de coordinateur de la plateforme MEREVA au sein de l'IDLIC UMR1219 à l'Université de Bordeaux depuis 2014. Il est également le coordinateur investigateur et directeur de projet pour TB-Speed au sein du même institut depuis 2017. Il est membre du Comité exécutif et co-coordinateur du WP5 « Urbanisation ».

Il a été médecin coordinateur à la Croix-Rouge française pour les programmes PTME (Prévention de la Transmission Mère-Enfant) & VIH/SIDA de 2002 à 2005. Il a ensuite occupé le poste de coordinateur médical pour le programme VIH/SIDA de la Croix-Rouge française de 2005 à 2007. Au fil des années, Olivier Marcy a assumé divers rôles, tels que coordinateur de pays pour le programme CAMELIA d'essai clinique, coordinateur national du Programme ESTHER pour les soins et le traitement du VIH, gestionnaire de projet pour la Cohorte MEMENTO, et gestionnaire international de l'essai ANRS 12300 Reflate TB 2.

Ses travaux se concentrent sur l'épidémiologie médicale, avec une expertise particulière dans les domaines du VIH, de la tuberculose, de la pédiatrie et des diagnostics, en mettant l'accent sur les pays à faibles et moyens revenus, notamment en Afrique subsaharienne.