Véronique Yoboué occupe actuellement le poste de Vice-présidente en charge de la Planification, de la Programmation et des relations extérieures à l’Université Félix Houphouët Boigny et Professeur titulaire des Universités. Elle est responsable de la filière Climat et Interactions au Centre d’Excellence Africain sur les Changements Climatiques, la Biodiversité et l’Agriculture Durable (CEA-CCBAD) à Bingerville. Elle occupe la présidence du conseil scientifique du Centre Suisse de Recherche Scientifique (CSRS) depuis janvier 2023. Elle est membre du Comité exécutif et co-coordinatrice du WP5 « Urbanisation ».

Véronique Yoboué a été membre du comité scientifique du Réseau National d’Observation de la qualité de l’Air (RNO-AIR) au sein du Centre Ivoirien anti-pollution (CIAPOL). Elle a également contribué au comité de pilotage du PTUA (Projet des Transports Urbains d’Abidjan), en charge de l’étude pilote de la qualité de l’air en lien avec le transport. Elle a joué un rôle majeur en tant que membre du comité d’INDAAF (International Network of Deposition and Atmospheric Chemistry in Africa), responsable de l’organisation du réseau de mesure des caractéristiques chimiques des dépôts atmosphériques sur le continent africain depuis 1995. Véronique Yoboué a coordonné plusieurs projets d'envergure, dont le projet PASMU (Pollution de l’Air et Santé en Milieux Urbains) de 2018 à 2021, et a assumé le rôle de coordinatrice de la Chaire Pollution au sein de la Chaire ÉcoSanté (CRDI) de 2017 à 2019.

Actuellement, elle coordonne le projet APPIMAMA (Air Pollution Mitigation Actions for Megacities in Africa) de 2022 à 2025 et continue d'être une force motrice dans des projets de recherche nationaux, européens et internationaux axés sur l'Afrique.